आतापर्यंत पोकरा योजनेत शेडनेट, पॅक हाऊस, सामूहिक शेततळे, कांदा चाळ, भाजीपाला नर्सरी, ट्रॅक्टर तसेच विविध कृषी उपकरणांवर 75 टक्क्यांहून अधिक अनुदान देण्यात येत होते. त्यामुळे या योजनेकडे शेतकऱ्यांचा कल मोठ्या प्रमाणात वाढला होता. परंतु ही योजना फक्त निवडक गावांपुरती मर्यादित असल्यामुळे राज्यातील अनेक शेतकरी या फायद्यापासून दूर राहिले. दुसरीकडे, महाडीबीटी पोर्टलवर तेच प्रकल्प घेतल्यास केवळ 50 टक्के अनुदान उपलब्ध होते.
या विसंगतीमुळे दोन योजनांमध्ये मोठा तफावत निर्माण झाला आणि अन्य भागातील शेतकरी असमाधानी होते. विविध शेतकरी संघटनांनी याबाबत शासनाचे लक्ष वेधल्यानंतर, सरकारने पोकरा टप्पा 2 लागू करताना दोन्ही योजनांना समान 50% अनुदान देण्याचा निर्णय घेतला. शासनाच्या मते, हा बदल अधिक पारदर्शक, समतोल आणि सर्वसमावेशक लाभ देण्यासाठी अत्यावश्यक होता.